Zespół, który w 2011 i 2012 roku dotarł do dwóch kolejnych finałów Pucharu Grecji.
Domowym stadionem Atromitosu jest stadion miejski w Peristeri. Przed igrzyskami olimpijskimi w Atenach w 2004 roku zamknięto go na czas prac przy oświetleniu, murawie i bieżni. W 2009 roku od maja do października powstawało zadaszenie, a w 2012 roku ukończono pomieszczenia medyczne i zaplecze dla mediów na mecze europejskie.
Atromitos powstał w 1923 roku. Klub nosi numer 14 w rejestrze greckiej federacji piłkarskiej.
Od 2005 roku klub zaczął działać według ściśle zawodowych standardów. Pod wodzą Jorgosa Paraschosa zespół zapewnił sobie pierwszy udział w europejskich rozgrywkach dzięki siódmej pozycji w lidze. W debiucie w Pucharze UEFA zmierzył się z Sevillą, ówczesnym zdobywcą trofeum.
Po spadku w sezonie 2007/08 Atromitos wrócił do najwyższej ligi w kolejnej edycji rozgrywek. Drużyna Jorgosa Donisa dotarła następnie do dwóch kolejnych finałów Pucharu Grecji. W pierwszym, 30 kwietnia 2011 roku na Stadionie Olimpijskim w Atenach, przegrała z AEK 0:3.
28 kwietnia 2012 roku Atromitos zmierzył się w finale z Olympiakosem. Iglesias wyrównał w 76. minucie, doprowadzając do dogrywki. O zwycięstwie Olympiakosu 2:1 zdecydował gol Fustera w 119. minucie.
