Klub z Agrinio, którego historia od 1926 roku łączy piłkę nożną z prowadzeniem wieczorowej szkoły dla ubogich i pracujących dzieci.
Teren stadionu w Agrinio przekazał miastu dobroczyńca Velis, a samorząd udostępnił go następnie Panetolikosowi. Budowę finansowały zarówno władze miejskie, jak i miejscowe rodziny, w tym związana z przemysłem tytoniowym rodzina Papastratos.
Barwy klubu to żółty i niebieski. Ich symbolika odwołuje się do światła, siły, stabilności, rzeki Acheloos i kłosa zboża. W herbie widnieje Titormos, starożytny etolski bohater, który ma wyrażać zakorzenienie klubu, wytrzymałość i ducha rywalizacji.
Panetolikos powstał 9 marca 1926 roku jako stowarzyszenie gimnastyczne i oświatowe w Agrinio. W grudniu tego roku uruchomił wieczorową szkołę dla pracujących i ubogich dzieci z miasta. Obok futbolu rozwijał także siatkówkę i strzelectwo, a jego działalność edukacyjna pozwalała młodzieży zdobywać wykształcenie poza zwykłymi godzinami szkolnymi.
W sezonie 1954/1955 awansował do sześciozespołowej finałowej fazy mistrzostw Grecji jako mistrz południowej części kraju. Drogę do tego etapu otworzyło wyeliminowanie Panachaiki w Patras. Pierwszy awans do A’ Ethniki wywalczył wiosną 1975 roku, wygrywając południową grupę drugiej ligi o punkt przed Panelefsiniakosem. Zespół prowadził wówczas Giorgos Chasiotis, a w najwyższej klasie utrzymał się przez dwa sezony, od 1975 do 1977 roku.
Latem 2005 roku przyjście Fotisa Kostoulasa zapoczątkowało inwestycje w stadion, centrum treningowe i organizację zespołu. W maju 2011 roku Panetolikos zwyciężył w Football League i wrócił do najwyższej klasy rozgrywkowej. Drużynę tego awansu prowadził Babis Tennes, a jej kapitanem był Giorgos Theodoridis.
Po spadku z Super League klub ponownie wywalczył awans przez baraże w 2013 roku. Tym razem trenerem był Makis Chavos, a opaskę kapitana nosił Giorgos Kousas. Podczas obchodów stulecia wyróżniono obie drużyny za te powroty do najwyższej ligi.