Stoper wychowany w Bałtyku Koszalin, który przez akademię Pogoni Szczecin i jej rezerwy wszedł do seniorskiego futbolu.
Rafał Jakubowski urodził się 27 stycznia 2007 roku. Zaczynał w Bałtyku Koszalin, a w sezonie 2021/2022 przeszedł do akademii Pogoni Szczecin.
W wieku szesnastu lat związał się z Pogonią profesjonalnym kontraktem. Łączył występy w zespołach młodzieżowych z grą w rezerwach i regularnymi treningami z pierwszą drużyną.
W październiku 2025 roku po raz pierwszy zagrał na stadionie przy Twardowskiego, w sparingu z Wisłą Kraków. Występ uważał za spełnienie długoletniego marzenia i motywację do dalszej pracy, podkreślając, że codziennie uczy się od kolegów z zespołu.
Latem 2026 roku został wypożyczony do Chełmianki Chełm, występującej w III lidze, czyli na czwartym poziomie rozgrywek. Dyrektor sportowy Wojciech Wójcik zwracał uwagę na jego swobodę gry z piłką, warunki fizyczne oraz doświadczenie zdobyte w trzecioligowych rezerwach i na treningach pierwszego zespołu Pogoni. Pozyskanie Jakubowskiego miało zwiększyć rywalizację w defensywie oraz dać Chełmiance więcej możliwości przy zestawianiu składu z młodzieżowcem.
| Sezon | Klub | Rozgrywki | M | Min | Gole | Asysty |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2025/2026PKO BP Ekstraklasa | Pogoń Szczecin | PKO BP Ekstraklasa | 0 | – | 0 | 0 |
| 2024/2025 | Pogoń Szczecin II | – | – | – | – | |
| 2023/2024Puchar Polski | Pogoń Szczecin II | Puchar Polski | 0 | – | 0 | 0 |




