Biało-niebiescy z Kujaw, którzy w sezonie 2006/2007 grali na zapleczu ekstraklasy, a później odbudowywali klub od B klasy.
Z Unią związany jest stadion przy ulicy Głównej 40 w Janikowie. W 2017 roku jego patronem został Bolesław Ciesielski, dawny piłkarz i wieloletni gospodarz obiektu.
Barwy klubowe są biało-niebieskie.
Tradycja Unii sięga 1958 roku. W 2006 roku zespół przegrał baraż z Polonią Bytom, ale dostał miejsce w ówczesnej II lidze po wycofaniu Kanii Gostyń. Na drugim szczeblu spędził jeden sezon. O spadku przesądził baraż z Wartą Poznań, rozstrzygnięty liczbą goli strzelonych na wyjeździe.
Po wycofaniu MLKS Unia z rozgrywek w sezonie 2012/2013 powstało nowe stowarzyszenie KS Unia. Przejęło grupy młodzieżowe, a seniorzy zaczęli od B klasy. Drużynę oparto na wychowankach.
W 2020 roku Unia zdobyła wojewódzki Puchar Polski po finale z Zawiszą Bydgoszcz, rozstrzygniętym w rzutach karnych. W rozgrywkach ogólnopolskich pokonała następnie Zagłębie Sosnowiec 1:0.
W lutym 2023 roku zarząd wycofał pierwszą drużynę z III ligi z powodu problemów finansowych. Klub zachował szkolenie młodzieży.
