Klub z Kiszyniowa, pierwszy mistrz niepodległej Mołdawii, który w latach 1992–2000 zdobył osiem tytułów.
Zimbru gra na własnym stadionie w Kiszyniowie, otwartym 20 maja 2006 roku meczem towarzyskim z rosyjskim klubem Krylja Sowietow Samara, zremisowanym 1:1. Budowa trwała trzy lata. Obiekt mieści 10 500 widzów i był pierwszym w Kiszyniowie stadionem spełniającym międzynarodowe normy.
Zimbru gra w barwach żółto-zielonych i od nich pochodzi przydomek „galben-verzii”, czyli „żółto-zieloni”. Nazwę, która oznacza żubra, klub przyjął na początku 1991 roku. Wcześniejsza nazwa Nistru odnosiła się do rzeki Dniestr, płynącej kilkadziesiąt kilometrów od stolicy. Działacze chcieli nazwy związanej z Kiszyniowem i z symbolami narodowymi, a żubra przedstawiali jako symbol siły, piękna i odrodzenia.
Za datę założenia klub uznaje 16 maja 1947 roku, gdy Dinamo Kiszyniów zadebiutowało w rozgrywkach ligi ZSRR. Później drużyna nazywała się Burevestnik, Moldova, Avîntul i Nistru. W okresie radzieckim spędziła w najwyższej lidze jedenaście sezonów, najlepiej spisując się w 1956 roku, gdy zajęła szóste miejsce. 11 września 1957 roku w Moskwie przegrywała ze Spartakiem 0:4, a mimo to zremisowała 4:4.
Po rozpadzie ZSRR Zimbru od wiosny 1992 roku grało w lidze niepodległej Mołdawii i zdobyło pięć pierwszych tytułów. Za każdym razem drugi był Tiligul Tyraspol. W sezonie 1996/1997 mistrzem został Constructorul-93 Kiszyniów, ale Zimbru wygrało w tym roku pierwszy Puchar Mołdawii, pokonując w finale Nistru Otaci po rzutach karnych. W 1998 roku jako pierwsze w Mołdawii zdobyło dublet, a ostatni tytuł mistrzowski wywalczyło w 2000 roku pod wodzą ukraińskiego trenera Aleksandra Skripnika.
Do 2024 roku najwięcej meczów (249) i goli (129) dla Zimbru w lidze mołdawskiej rozegrał i strzelił napastnik Iurie Miterev. Obrońcę Iona Testemițanu wybierano najlepszym piłkarzem Mołdawii w 1995 i 1997 roku.
Zimbru było pierwszym mołdawskim klubem w europejskich pucharach: w eliminacjach Ligi Mistrzów 1993/1994 zremisowało z Beitarem Jerozolima 1:1 i przegrało rewanż 0:2. W 1999 i 2000 roku zatrzymało się w trzeciej rundzie eliminacji Ligi Mistrzów, odpadając z PSV Eindhoven i Spartą Praga. W 2014 roku dotarło do rundy play-off Ligi Europy, w której przegrało z PAOK. W tym samym roku zdobyło Puchar i Superpuchar Mołdawii.
W latach 90. o tytuły Zimbru rywalizowało z Tiligulem Tyraspol. Od sezonu 2000/2001 mołdawską ligę zdominował Sheriff Tyraspol. Z nim Zimbru wygrało Superpuchar w 2014 roku po rzutach karnych i przegrało finał pucharu w 2026 roku.