Klub ze stolicy Dolnej Austrii, który jako drugoligowiec zagrał w 2014 roku w finale Pucharu Austrii i w eliminacjach Ligi Europy.
Od lipca 2012 roku SKN St. Pölten gra na NV Arenie. Stadion otwarto 7 lipca 2012 roku turniejem z udziałem Rapidu Wiedeń i Sparty Praga; gospodarze zremisowali z oboma rywalami 0:0. Budowę za 26 milionów euro sfinansowały wspólnie kraj związkowy, państwo i miasto.
Piłkarzy SKN nazywa się „Wölfe”, czyli „Wilki”, od wilka w herbie klubu. Wilk widnieje również w herbie St. Pölten.
Klub założono 6 lipca 2000 roku, po rozwiązaniu FCN St. Pölten. Ten z kolei był następcą VSE St. Pölten, który w 1994 roku spadł z najwyższej ligi po pięciu sezonach. Klub nazywa FCN swoim nieoficjalnym poprzednikiem. Przejął po nim infrastrukturę, stadion i patronat nad krajowym ośrodkiem szkolenia młodzieży. Dzięki temu nie musiał zaczynać od najniższej klasy rozgrywkowej, tylko od piątego poziomu.
W pierwszych dwóch sezonach drużyna wygrywała kolejne ligi regionalne i w 2002 roku awansowała do Regionalligi Ost. Wygrała ją w sezonie 2007/08 i awansowała na drugi poziom rozgrywek.
W sezonie 2013/14 drugoligowiec doszedł do finału Pucharu Austrii, eliminując po drodze SV Ried i Sturm Graz. W finale w Klagenfurcie 18 maja 2014 roku przegrał z Red Bull Salzburg 2:4. Udział w finale dał St. Pölten miejsce w eliminacjach Ligi Europy. Jako pierwszy austriacki drugoligowiec przeszedł w nich rundę, pokonując Botew Płowdiw w dwumeczu 3:2. W następnej rundzie odpadł z PSV Eindhoven po porażkach 0:1 i 2:3.
20 maja 2016 roku zespół Karla Daxbachera wygrał 3:0 z SC Wiener Neustadt i na kolejkę przed końcem zapewnił sobie mistrzostwo Erste Liga oraz pierwszy w historii klubu awans do Bundesligi. Stolica Dolnej Austrii wróciła tym samym do ekstraklasy po 22 latach.
Po pięciu sezonach w najwyższej lidze St. Pölten spadł w maju 2021 roku, przegrywając baraż z Austrią Klagenfurt 0:4 i 0:1. Od tego czasu gra w 2. Lidze. W ostatnich latach klub przeszedł kilka zmian właścicielskich i partnerskich: od współpracy z VfL Wolfsburg, przez FC32, po grupę inwestorów Dietmara Wiesera.
