Klub z Paoli na Malcie, który w Pucharze Europy 1967/68 zremisował bezbramkowo z Manchesterem United.
Z klubem związany jest Tony Bezzina Stadium w Kordin, otwarty 9 listopada 1986 roku jako Hibernians Ground. W 2021 roku członkowie klubu zdecydowali o nadaniu mu imienia Tony’ego Bezziny, który pełnił funkcję prezesa przez 43 lata, od 1978 roku.
Piłkarskie korzenie Hibernians wiążą się z amatorską drużyną Constitutionals z Paoli. Pierwsze mistrzostwo Malty klub zdobył w sezonie 1960/61, po rywalizacji z Vallettą. Jimmy Mizzi strzelił oba gole w zwycięskim meczu 2:1 z Vallettą w przedostatniej kolejce, który rozstrzygnął walkę o tytuł.
W sezonie 1961/62 Hibernians jako pierwszy maltański zespół wystąpił w Pucharze Europy, przegrywając dwumecz z Servette 1:7. W edycji 1967/68 po porażce 0:4 na Old Trafford zatrzymał Manchester United w bezbramkowym rewanżu na Empire Stadium. W drużynie rywala grali wtedy między innymi George Best, Bobby Charlton i Denis Law.
Brian Talbot objął zespół w sezonie 1992/93 i przed następnym sezonem postawił w bramce na 17-letniego wychowanka Mario Muscata. Muscat pomógł Hibernians zdobyć mistrzostwa w 1994 i 1995 roku, a także Puchar Malty w edycji 1997/98, w której klub pokonał w finale Vallettę 2:1. W 1998 roku bramkarza wybrano piłkarzem roku na Malcie.
18 kwietnia 2015 roku Hibernians zapewnił sobie mistrzostwo dzięki wygranej 3:1 z Florianą. 1 maja 2022 roku Hibernians pokonał Birkirkarę 3:1 i zapewnił sobie mistrzostwo Malty. 18 maja 2025 roku klub wygrał z tym samym rywalem 2:1 w finale Pucharu Malty, a decydującego gola strzelił głową Kurt Shaw w 80. minucie.
