Akademia z Szawli, która w drugim sezonie A Lygi, w 2023 roku, zdobyła ligowy brąz i dotarła do finału Pucharu Litwy.
Drużyna rozgrywa mecze na stadionie miejskim w Szawlach, przy ulicy S. Daukanto 23. Akademia zarządza również dwoma stadionami w dzielnicy Gytariai. Na miejscu obecnego stadionu miejskiego mecze odbywały się już pod koniec lat 30. XX wieku.
Zespół występuje w żółci i czerni. We wrześniu 2025 roku uczcił stulecie futbolu w regionie, grając w jubileuszowych strojach wzorowanych na miejscowych koszulkach z 1925 roku.
Akademia rozpoczęła działalność w 2007 roku. Od 3 stycznia 2018 roku obecna instytucja kontynuuje działalność wcześniejszej akademii miejskiej, finansowanej z budżetu. W 2019 roku męski zespół przystąpił do I Lygi, drugiego poziomu rozgrywek na Litwie. Wygrał ją w 2021 roku i w 2022 roku zadebiutował w A Lydze.
W kolejnym sezonie drużyna Mindaugasa Čepasa zajęła trzecie miejsce w najwyższej lidze. Brąz zapewniła sobie w ostatniej kolejce, pokonując Bangę Gargždai 3:0. Čepas oparł zespół głównie na litewskich piłkarzach, przekonując ich, że mogą rywalizować o najwyższe miejsca.
W 2023 roku FA Šiauliai dotarła także do finału Pucharu Litwy. Urodzony w Szawlach Eligijus Jankauskas otworzył wynik po podaniu Daniela Romanovskija. Drużyna nie utrzymała jednak prowadzenia: 1 października w Kownie przegrała z FK TransINVEST 1:2.
