Mimo kilku ofert transferowych dla Peruwiańczyka Vargas postanowił pozostać we Włoszech, aby walczyć o Europejskie Puchary

Jak donoszą włoskie media, do klubu wpłynęła oferta ze Stambułu. Włodarze zespołu Fenerbahce gotowi byli zapłacić za Peruwiańczyka 15 milionów euro. Jednak 26-letni pomocnik oznajmił: – Chcę zostać w Fiorentinie i wygrać Ligę Mistrzów.
Juan Manuel Vargas przyznaje, że to Fiorentina jest klubem, w którym chce grać i odnosić sukcesy. Zapytany przez dziennikarzy „Yahoo Sport”, gdzie widzi swoją przyszłość, odpowiedział: „Fiorentina jest moją przyszłością”.
Vargas został sprowadzony do Fiorentiny 5 lipca 2008 roku z Calcio Catania za 12 milionów euro.