Klub z maltańskiej wioski rybackiej Marsaxlokk, który w sezonie 2006/07 zdobył swoje jedyne mistrzostwo kraju.
W herbie zaprezentowanym w 2025 roku wykorzystano kształt i kolorystykę tradycyjnej maltańskiej łodzi rybackiej luzzu oraz elementy wcześniejszych znaków klubu.
Marsaxlokk FC powstał w 1949 roku. Przydomek „Southseasiders” nawiązuje do położenia klubu w rybackiej miejscowości na południu Malty.
Największy sukces przyniósł sezon 2006/07, gdy drużyna prowadzona przez Briana Talbota po raz pierwszy wygrała ligę maltańską. Latem 2007 roku przygotowywała się do debiutu w eliminacjach Ligi Mistrzów przeciwko FK Sarajevo, choć przed dwumeczem straciła kilku ważnych zawodników. W sezonie 2025/26 ponownie była blisko tytułu, lecz przegrała finał rozgrywek ligowych z Florianą.
Marsaxlokk gra u siebie na stadionie Marsaxlokk Ground. Stadion mieści 150 widzów.