Jan Navrátil to wychowanek Sigmy Ołomuniec, który po dwóch spadkach i kilku latach poza klubem zdecydował się do niego wrócić.
Do Sigmy Ołomuniec trafił w 2001 roku po grze w młodzieżowym zespole z Przerowa. Był z klubem zarówno podczas dobrych sezonów, jak i dwóch spadków. Po degradacji w 2014 roku pomógł mu wrócić do najwyższej ligi, lecz po kolejnym spadku w 2016 roku odszedł do Liberca, a następnie na pięć lat do Slovácka. Odejście po drugim spadku nazywał jednym z najgorszych momentów kariery.
W styczniu 2022 roku ponownie został piłkarzem Sigmy. O powrocie myślał już przez poprzednie pół sezonu, a silne zainteresowanie klubu przekonało go do przyjęcia propozycji. Ołomuniec uważał za dom i chciał odwdzięczyć się drużynie, która dała mu szansę gry w ekstraklasie.
Powrót traktował też jako nowe wyzwanie, ponieważ z dawnej szatni znał już tylko kilku zawodników. Cieszył się na współpracę z młodszymi kolegami i podkreślał, że lubi obserwować ich postępy. Chciał pomóc zespołowi uzyskać lepszy wynik niż ten, z którym opuszczał go w 2016 roku.
| Sezon | Klub | Rozgrywki | M | Min | Gole | Asysty |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2026The Atlantic Cup | Artis | The Atlantic Cup | 1 | 90 | 1 | 0 |
| 2025/2026Liga Konferencji | Sigma Olomouc | Liga Konferencji | 5 | 260 | 0 | 0 |
| 2025/2026Liga Europy | Sigma Olomouc | Liga Europy | 1 | 68 | 0 | 0 |