Klub z Rrogozhinë, zdobywca pierwszego Pucharu Albanii w 2023 roku i trzech kolejnych mistrzostw kraju w latach 2024–2026.
Domowym stadionem klubu jest Arena Egnatia w Rrogozhinë.
Barwy Egnatii są zielono-czarne.
Egnatia powstała w 1934 roku w Rrogozhinë. W 2021 roku wróciła do Kategorii Superiore po 16 latach, wygrywając rozgrywki Kategorii e Parë. Finał z Dinamem rozstrzygnął Ndriçim Shtubina: jego gol w 93. minucie dał Egnatii zwycięstwo 1:0.
Pierwszy Puchar Albanii klub zdobył w 2023 roku, gdy Xhekson w 114. minucie finału z Tiraną dobił własny rzut karny obroniony przez bramkarza i ustalił wynik na 1:0. Rok później Egnatia obroniła puchar, pokonując Kukësi 1:0 po golu Edisona Ndreci.
W maju 2024 roku dołożyła pierwsze mistrzostwo Albanii: w finale turnieju Final Four wygrała z Partizani 1:0 dzięki bramce Ibrahimoglu. W 2025 roku ponownie zdobyła tytuł, tym razem wygrywając finał z Vllaznią 4:0; dwa gole strzelił Lushkja. Trzecie mistrzostwo z rzędu zapewniło jej w 2026 roku zwycięstwo 2:0 nad Dinamo City w kończącym rozgrywki meczu Final Four, w którym obie bramki zdobył Alessandro Albanese.
W kwalifikacjach Ligi Mistrzów w 2024 roku Egnatia odpadła w pierwszej rundzie z Boracem po serii rzutów karnych.
