Jako kapitan Trepçy ’89 pomógł drużynie wrócić do kosowskiej ekstraklasy w sezonie 2021/2022.
Ardian Muja urodził się 9 grudnia 1997 roku w Mitrowicy.
Przez sześć sezonów grał w Trepçy ’89, a pod koniec tego okresu nosił opaskę kapitana. Po spadku zespół spędził rok na zapleczu kosowskiej ekstraklasy i wywalczył powrót. Muja wspominał, że degradacja była dla niego trudna, a w walce o awans pomogły praca drużyny i sztabu oraz wsparcie kibiców.
W czerwcu 2023 roku podpisał kontrakt z Prishtiną. Mówił, że łatwo przyjął jej ofertę i chce pomóc drużynie odzyskać mistrzostwo kraju.